若员工明知收入证明是虚假的仍用于申请贷款，则员工可能构成骗取贷款罪的共犯，需承担相应的刑事责任。 若员工以非法占有为目的，利用虚假收入证明骗取贷款后拒不归还，则可能构成贷款诈骗罪，需根据《人民刑法》的相关规定承担刑事责任。 综上所述，公司为员工出具虚假收入证明贷款的行为后果严重。